Приказом № 244 от 5 мая 1930 года по Народном Комиссариату просвещения Нижегородский университет был реорганизован с выделением из его состава шести самостоятельных институтов, в том числе и медицинского.
Начальной датой самостоятельного существования институтов по этому приказу считается 7 мая 1930 года.
Директором медицинского института назначен Яков Самуилович Моносзон. C этого времени начинается новый этап в развитии высшего медицинского образования в Нижнем Новгороде - Горьком.
За 9 лет существования медицинского факультета Нижегородского университета было выпущено 400 врачей.
Молодой мединститут получил весьма скудное наследство от медицинского факультета - все клинические и теоретические кафедры пришлось создавать заново. В 1930 году в мединституте работала 8 профессоров, 12 доцентов, 26 ассистентов, 13 ординаторов и 6 научных сотрудников.
В 1931 году Я.С. Моносзона сменил Семен Алексеевич Чесноков, руководивший институтом до 1937 года. С августа 1937 по ноябрь 1940 года директором ГМИ был Иван Георгиевич Кочергин. В этот период институт вел большую работу по дальнейшему улучшению качества преподавания и углубления научно-исследовательской работы.
